Что бы посмотреть сколько у вас FPS в CS в данный момент, пропишите в консоли «net_graf 3» или «cl_showfps 1» без кавычек.
Настройка монитора

На рабочем столе нажмите правую кнопку мыши, дальше так: Свойства -> Параметры -> Дополнительно -> Монитор.

Убедитесь, что в пункте «Скрыть режимы, которые монитор не может использовать» стоит галочка и поставьте самую высокую частоту, на которую способен ваш монитор. Для ЖК мониторов это 72-75, а для CRT 100.
Настройка Counter-Strike

Внимание! Данный пункт [Настройка Counter-Strike] является обязательным! Т.е., если без какого-либо из нижеследующих можно обойтись, то без этого — никак. Более того, для многих из вас этот пункт станет единственным на пути увеличения FPS в CS 1.6 до максимального значения.
about-cs.ru

То есть сначала выполните то, что написано пункта «Настройки видеокарты», перезапустите CS и проверьте как обстоят дела с FPS и, если же он не поднялся до 100 (75), то читайте информацию ниже.

Если у вас Steam,

ищите раздел «Мои игры», жмите правой кнопкой по Counter-Strike, и выберите свойства. Там жмите на «установить параметры запуска» и пишите в конце через пробел и без кавычек «-freq 75» или «-freq 100» в зависимости от вашего монитора.

Если у вас no-Steam (пиратская, скачали с интернета),

жмите правой кнопкой мыши по ярлыку Counter-Strike 1.6, там ищите строку «объект», и добавляйте в конце через пробел и без кавычек «-freq 75» или «-freq 100» в зависимости от вашего монитора.
Настройки видеокарты

Если у вас мощная видеокарта, можете пропустить этот пункт.

Для тех, у кого видеокарта от NVIDIA,

заходим в настройки видеокарты, ищем меню «Производительность и качество», там ищем «Вертикальная синхронизация (vsync)» и жмем на нее. Снимите галочку с «Управляемое приложением», а ползунок подвиньте влево.

Для тех, у кого видеокарта от ATI (Radeon),

на рабочем столе нажмите правую кнопку мыши, дальше так: Свойства -> Параметры -> Дополнительно -> 3D -> OpenGL -> Специальные. В пункте "Вертикальная синхронизация (vsync)" подвиньте ползунок влево.
Драйвера

Пункт не обязательный, но тем кому выше сказанного не хватило...

Драйвера — это ключ к хорошей производительности в играх.
Здесь дать какой-то совет нельзя, т.к. с драйверами версии 90.1 может быть 100 FPS, а с версией 90.3 70 фпс и не более.

Прежде чем устанавливать новые драйвера необходимо удалить старые, дабы избежать ошибок при установке.
P.S. поправте, если где ошибся....